داستان این بازی درست همانند نسخه ی قدیمی در دهه ۱۹۵۰ آمریکا جریان دارد و شما در نقش یک موجود فرازمینی به نام Crypto-137 پا روی کره ی آبی زمین می گذارید. در قالب این موجود شما می توانید خود را به شکل انسان ها درآورید، از سلاح ها و قدرت های خاص خود استفاده کنید و در منطقه ی ممنوعه ی Area 42 قدم بگذارید و به انجام ماموریت های فرازمینی خود بپردازید.